RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DGKA	P23743	735 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ACRV1	P26436	265 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A2	P31639	672 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CD70	P32970	193 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RANBP1	P43487	201 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB2	Q8N680	514 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CGREF1	Q99674	301 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO1	Q9UM00	188 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DFNA5	O60443	496 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LMAN2	Q12907	356 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PLCL1	Q15111	1095 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	VAPA	Q9P0L0	249 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CLOCK	O15516	846 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SNAP29	O95721	258 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LDLR	P01130	860 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	UROD	P06132	367 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	IMPG1	Q17R60	797 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM73	Q86UV7	250 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PDPR	Q8NCN5	879 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GPR26	Q8NDV2	337 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FIG4	Q92562	907 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OARD1	Q9Y530	152 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD28	O15084	1053 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ULK1	O75385	1050 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SEC22B	O75396	215 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RASAL1	O95294	804 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HTR1E	P28566	365 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CD244	Q9BZW8	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FCGR1A	P12314	374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZNB5	142 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GAREM2	Q75VX8	874 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LIX1	Q8N485	282 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OR10A6	Q8NH74	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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