RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRPB2Q5JXA9 342 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPREQ86SM8 312 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC1AQ8NC01 280 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DTX3LQ8TDB6 740 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFM3Q96PB7 478 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SYTL2Q9HCH5 934 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HACD3Q9P035 362 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQJ5 194 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 E7EQ34 232 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MATN2O00339 956 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT1P04264 644 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFZP0C0S5 128 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN3P26045 913 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MLIPQ5VWP3 458 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QL3Q5VWW1 255 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFVQ71UI9 128 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2L2Q8NH16 312 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN9Q8WX39 176 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RMDN2Q96LZ7 410 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL25Q9H0H3 589 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX12O00623 359 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 NFKB1P19838 968 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GLRBP48167 497 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBED6P86452 979 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1I3Q14994 352 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TM9SF4Q92544 642 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TEKT5Q96M29 485 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IP6K3Q96PC2 410 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GBP4Q96PP9 640 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP9Q96S59 729 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF487B1APH4 448 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF749O43361 778 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF1O95521 474 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HBQ1P09105 142 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ST6GAL1P15907 406 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF789Q5FWF6 425 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KDELC1Q6UW63 502 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT16Q8N428 558 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZADH2Q8N4Q0 377 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ACVR1CQ8NER5 493 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF398Q8TD17 642 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS4Q9BTZ2 278 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PACSIN1Q9BY11 444 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DEF6Q9H4E7 631 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SMOXQ9NWM0 555 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 STX7O15400 261 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL41O60662 606 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBPC3Q14896 1274 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DAAM2Q86T65 1068 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP206Q8IYR0 622 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR135Q8IZ08 494 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IPMKQ8NFU5 416 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 FERD3LQ96RJ6 166 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf62Q9BQA9 187 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL33A6NCF5 533 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHEP01854 428 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PYGMP11217 842 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PVRP15151 417 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CD68P34810 354 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 FOLR3P41439 243 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF10Q5QP82 559 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 DCUN1D1Q96GG9 259 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF12Q96QT6 1004 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 BTN3A1O00481 513 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO13O94829 963 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNT1P13805 278 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HADHAP40939 763 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SSPNQ14714 243 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRCAPQ14761 206 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC1A5Q15758 541 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf189Q5VU69 101 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HOOK3Q86VS8 718 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CCM2Q9BSQ5 444 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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