RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF843	Q8N446	348 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ESX1	Q8N693	406 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF18A	Q8NI77	898 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HM13	Q8TCT9	377 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CATSPER2	Q96P56	530 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CASS4	Q9NQ75	786 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		16.89	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2AG2	A6NM03	316 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MU76	341 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MATN2	O00339	956 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SGTA	O43765	313 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DLGAP3	O95886	979 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF5	P12034	268 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK9	P45984	424 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TERF1	P54274	439 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MC1R	Q01726	317 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PTK6	Q13882	451 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NFE2L1	Q14494	772 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC3	Q5W041	872 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SGSM3	Q96HU1	749 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RANBP9	Q96S59	729 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC1	Q99614	292 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IL22	Q9GZX6	179 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC23	Q9UJX2	597 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD3	Q9Y597	815 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		16.88	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		F8W8V4	182 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAP	O00193	183 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-ND3	P03897	115 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ACRV1	P26436	265 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CA5A	P35218	305 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS15	P98073	1019 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG1	Q06432	222 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ITIH4	Q14624	930 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRCAP	Q14761	206 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PCID2	Q5JVF3	399 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MNS1	Q8NEH6	495 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8K5	Q8NH50	307 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TGM7	Q96PF1	710 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT12	Q99456	494 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		16.87	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB16	A2A368	324 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR39	O43194	453 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	STK17B	O94768	372 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MLN	P12872	115 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TYRP1	P17643	537 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MC4R	P32245	332 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NSG1	P42857	185 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA6	P43360	314 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GFER	P55789	205 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PACS1	Q6VY07	963 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	BBOF1	Q8ND07	529 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MCU	Q8NE86	351 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RSC1A1	Q92681	617 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE7B	Q9NP56	450 aa		16.86	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SDK2	Q58EX2	2172 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5K3	A6NET4	321 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM187A	A6NFU0	413 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TLCD2	A6NGC4	264 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424		B8ZZF3	427 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCG	O15287	622 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MSL3P1	P0C860	447 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAME	P78395	509 aa		16.85	■□□□□ 0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ACY1	Q03154	408 aa		16.85	■□□□□ 0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms