RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNNT1P13805 278 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 NFKB1P19838 968 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 WNT3AP56704 352 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TUBB4BP68371 445 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDE1BQ01064 536 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TUBB2AQ13885 445 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 LCN10Q6JVE6 187 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDELC1Q6UW63 502 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1328Q86T90 577 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KMT5CQ86Y97 462 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TEKT5Q96M29 485 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHST8Q9H2A9 424 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCSK5Q92824 1860 aa20.35■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 A1L4Q6 167 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 OR6C74A6NCV1 312 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 AKT1P31749 480 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 VAV2P52735 878 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 LLGL1Q15334 1064 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 OOSP2Q86WS3 158 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 C12orf66Q96MD2 445 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD180Q99467 661 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 DESI2Q9BSY9 194 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TLR10Q9BXR5 811 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 MFRPQ9BY79 579 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 IL17CQ9P0M4 197 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCNJ13O60928 360 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 WASHC5Q12768 1159 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABRQ12979 859 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTPRCAPQ14761 206 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TCEAL1Q15170 157 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 VSIG1Q86XK7 387 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRABDQ9H4I3 376 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCND1Q9NSA2 647 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 SNX7Q9UNH6 387 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.33■□□□□ 0.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIF5AQ12840 1032 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 METRNLQ641Q3 311 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 Q8NA96 180 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 IPMKQ8NFU5 416 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAP10Q9P2G4 905 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.32■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 PJA2O43164 708 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC175P0C221 793 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ITGA9Q13797 1035 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ODF2Q5BJF6 829 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUDT9Q9BW91 350 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 CASS4Q9NQ75 786 aa20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms