RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 SLC9B2Q86UD5 537 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PIM3Q86V86 326 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 NXPE1Q8N323 547 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC89Q8N998 374 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 AVL9Q8NBF6 648 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 STYXQ8WUJ0 223 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ULK4Q96C45 1275 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TTC25Q96NG3 672 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 STRADBQ9C0K7 418 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 UCK1Q9HA47 277 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CASS4Q9NQ75 786 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 KCNK4Q9NYG8 393 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PDP2Q9P2J9 529 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 WDR37Q9Y2I8 494 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ATMQ13315 3056 aa11□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 LILRA5A6NI73 299 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PLD2O14939 933 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ZSCAN12O43309 604 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 APRTP07741 180 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ITGA2BP08514 1039 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 THRAP10827 490 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 VCLP18206 1134 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 MSH3P20585 1137 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 IDSP22304 550 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 AKT1P31749 480 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 MC4RP32245 332 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 KCNJ1P48048 391 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ARSDP51689 593 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 LIMK2P53671 638 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 BIRC2Q13490 618 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SEPT6Q14141 434 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CLCA4Q14CN2 919 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 GPR33Q49SQ1 333 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC38Q502W7 563 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 AMZ2Q86W34 360 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PIANPQ8IYJ0 282 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SLC35F6Q8N357 371 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 FBXO39Q8N4B4 442 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 OR4D9Q8NGE8 314 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 NAT14Q8WUY8 206 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM159Q96B96 161 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SGF29Q96ES7 293 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PBKQ96KB5 322 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 RANBP9Q96S59 729 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SLC38A3Q99624 504 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 THSD1Q9NS62 852 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10.99□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 MGAT4DA6NG13 374 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TNFSF15O95150 251 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PRSS56P0CW18 603 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 HGFP14210 728 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ACRV1P26436 265 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PRLHRP49683 370 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ACVR1Q04771 509 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 NFE2L1Q14494 772 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 CYP1B1Q16678 543 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 PHF19Q5T6S3 580 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 METRNLQ641Q3 311 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TTC27Q6P3X3 843 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 C4orf22Q6V702 233 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 DET1Q7L5Y6 550 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 OR2L2Q8NH16 312 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 OR10G6Q8NH81 332 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 COG1Q8WTW3 980 aa10.98□□□□□ -0.65
SMAD4-211ENST00000590499 HEXDCQ8WVB3 486 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms