RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 IGFBP2P18065 325 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 GPD1P21695 349 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 MMP8P22894 467 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 FOLR3P41439 243 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 SPINT3P49223 89 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 TPI1P60174 286 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP2R2AP63151 447 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 CA9Q16790 459 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM198Q66K66 360 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 AGAP4Q96P64 663 aa7.45□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.45□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.44□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 CDYLQ9Y232 598 aa7.44□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC66A2RUB6 948 aa7.43□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 H3BMH7 237 aa7.43□□□□□ -1.22
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SMARCE1-217ENST00000580654 MTX2O75431 263 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 GNA14O95837 355 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 MSL3P1P0C860 447 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR89BP0CG08 455 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT3P12035 628 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP2A7P20853 494 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 AGXTP21549 392 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 IDSP22304 550 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 HTR7P34969 479 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 AIF1P55008 147 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 ADAM8P78325 824 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 ADCY2Q08462 1091 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 MFAP5Q13361 173 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC9A5Q14940 896 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.226e-7■■□□□ 13.5
SMARCE1-217ENST00000580654 C1orf189Q5VU69 101 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL35Q6PF15 583 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 BIVMQ86UB2 503 aa7.43□□□□□ -1.22
SMARCE1-217ENST00000580654 RETREG3Q86VR2 466 aa7.43□□□□□ -1.22
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