RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRTM4Q86VH4 590 aa2.32□□□□□ -2.04
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RNU6-277P-201ENST00000516272 OR4C3Q8NH37 302 aa2.32□□□□□ -2.04
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RNU6-277P-201ENST00000516272 BAK1Q16611 211 aa2.29□□□□□ -2.04
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