RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ALPIP09923 528 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CCKBRP32239 447 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MMP12P39900 470 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RGRP47804 291 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NDST2P52849 883 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RHOAP61586 193 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OGDHQ02218 1023 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ELP6Q0PNE2 266 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MTM1Q13496 603 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SPIDRQ14159 915 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LY6DQ14210 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 GRM3Q14832 879 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00303Q3SY05 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 EXD3Q8N9H8 876 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CNPY3Q9BT09 278 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1A2Q9Y585 309 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 FLNCQ14315 2725 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM202A6NGA9 273 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LGALS16A8MUM7 142 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 D6RAR5 112 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MATN2O00339 956 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MATN3O15232 486 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CREB3O43889 395 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TNFRSF1AP19438 455 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HTR1BP28222 390 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A2P31639 672 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT1A5P35504 534 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 INHBCP55103 352 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA1024LP59773 190 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 B4GALNT1Q00973 533 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RALGDSQ12967 914 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MAMLD1Q13495 774 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SYCP1Q15431 976 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CDSNQ15517 529 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CA9Q16790 459 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRED1Q7Z699 444 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SRLQ86TD4 932 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 GKN2Q86XP6 184 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PELI3Q8N2H9 469 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MED8Q96G25 268 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR92Q96MX6 357 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ADOQ96SZ5 270 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 AGPAT1Q99943 283 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 FGF22Q9HCT0 170 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OXSMQ9NWU1 459 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 DONSONQ9NYP3 566 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KLQ9UEF7 1012 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms