RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484971.1

GTPBP1-210, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-210	ENST00000484971	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971		A0A1B0GUH1	482 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	AURKA	O14965	403 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	GPR39	O43194	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CBSL	P0DN79	551 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	VCL	P18206	1134 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CYP2A7	P20853	494 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CBS	P35520	551 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	HADHA	P40939	763 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SSPN	Q14714	243 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	RELT	Q969Z4	430 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	NRTN	Q99748	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971		C9J4A7	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971		H3BMH7	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZNF749	O43361	778 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CCNC	P24863	283 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	LMAN1	P49257	510 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ARSE	P51690	589 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	BECN1	Q14457	450 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	KCNJ13	O60928	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ALOX12B	O75342	701 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	UMOD	P07911	640 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	FER	P16591	822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	CDH3	P22223	829 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	PREP	P48147	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.58	□□□□□ -0.23
GTPBP1-210	ENST00000484971	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	KCNK1	O00180	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	PEX12	O00623	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	HCRTR1	O43613	425 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	KLHL41	O60662	606 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	PVR	P15151	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	HTR1E	P28566	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	FOLR3	P41439	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	KCNK10	P57789	538 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	GBE1	Q04446	702 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	CDC16	Q13042	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	XRCC4	Q13426	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP1-210	ENST00000484971	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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