RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 GBX1Q14549 363 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 UCMAQ8WVF2 138 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SUSD6Q92537 303 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PDE5AO76074 875 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 EPHX1P07099 455 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 LAMP2P13473 410 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ADRB3P13945 408 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PTK2BQ14289 1009 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 GLYATL1Q969I3 302 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 COQ10AQ96MF6 247 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 S1PR5Q9H228 398 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RDH14Q9HBH5 336 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 WWOXQ9NZC7 414 aa22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD11O00231 422 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 INPP4BO15327 924 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM15Q13444 863 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 E2F5Q15329 346 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 AGKQ53H12 422 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CES5AQ6NT32 575 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DSELQ8IZU8 1212 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 KYQ8NBH2 561 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 DTD2Q96FN9 168 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 VPS35Q96QK1 796 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NPAS2Q99743 824 aa22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 H0Y858 1186 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 AREL1O15033 823 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CIB2O75838 187 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PKNOX1P55347 436 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ELMO1Q92556 727 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 CD244Q9BZW8 370 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 IPPKQ9H8X2 491 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 PDE10AQ9Y233 779 aa22.33■■□□□ 1.17
VSTM4-201ENST00000298454 NUAK1O60285 661 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 KATNA1O75449 491 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HGFP14210 728 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RPIAP49247 311 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ERFP50548 548 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CTSCP53634 463 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PAOXQ6QHF9 649 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.33■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM202A6NGA9 273 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MMP20O60882 483 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 AP2A2O94973 939 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CHEK2O96017 543 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ELP6Q0PNE2 266 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 DYRK4Q9NR20 520 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MRGBPQ9NV56 204 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TBX10O75333 385 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 KRT36O76013 467 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SOD1P00441 154 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN1P07384 714 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 LBPP18428 481 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 WASP42768 502 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SOX9P48436 509 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD8P48556 350 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 NME5P56597 212 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 XKR7Q5GH72 579 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 OR2T11Q8NH01 316 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ARL15Q9NXU5 204 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 OPTCQ9UBM4 332 aa22.32■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.31■■□□□ 1.16
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