RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF394	Q53GI3	561 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SCMH1	Q96GD3	660 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5K4	A6NMS3	321 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440		E7EQ34	232 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM23	O14925	209 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SIAH2	O43255	324 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	STX6	O43752	255 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10H2	O60403	315 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	NEMF	O60524	1076 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX2	O60749	519 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CLSTN1	O94985	981 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	VIP	P01282	170 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SCP2	P22307	547 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRB2	P47870	512 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	LIG3	P49916	1009 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	EFNA3	P52797	238 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ARFIP2	P53365	341 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DCDC1	P59894	354 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PAK1	Q13153	545 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf189	Q5VU69	101 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT17	Q6IS24	598 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DOK6	Q6PKX4	331 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf29	Q8N999	325 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1L3	Q8NH93	324 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	GPT2	Q8TD30	523 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	FBF1	Q8TES7	1133 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF516	Q92618	1163 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	QRFPR	Q96P65	431 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP44	Q9C0F1	390 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB33B	Q9H082	229 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	INTS13	Q9NVM9	706 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	FANCL	Q9NW38	375 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	MYH11	P35749	1972 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	KRIT1	O00522	736 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP2K7	O14733	419 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF749	O43361	778 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBED1	O96006	694 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT1	P04264	644 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINA7	P05543	415 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	F3	P13726	295 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A16	P16260	332 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ETFB	P38117	255 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SNAP23-223	ENST00000627440	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45

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