RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CUZD1Q86UP6 607 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.67□□□□□ -1.82
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF583Q96ND8 569 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TAAR2Q9P1P5 351 aa3.67□□□□□ -1.82
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RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 P2RY10O00398 339 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 DVL1O14640 695 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CREG1O75629 220 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE9AO76083 593 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ZWINTO95229 277 aa3.66□□□□□ -1.82
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RABGGTB-202ENST00000370826 MMP15P51511 669 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ARSEP51690 589 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SIRPAP78324 504 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MELKQ14680 651 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PACS1Q6VY07 963 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PTOV1Q86YD1 416 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SMPDL3BQ92485 455 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA4DQ92854 862 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 NODALQ96S42 347 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 CDRT15Q96T59 188 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.66□□□□□ -1.82
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPI3 338 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 TO15178 435 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.65□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 SCRN2Q96FV2 425 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM81BQ96LP2 452 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 C17orf77Q96MU5 243 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 EPYCQ99645 322 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP28Q9H239 520 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP27Q9H306 513 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MIOSQ9NXC5 875 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SWAP70Q9UH65 585 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM172BPA6NC97 362 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 GLOD5A6NK44 160 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 H0YIN7 160 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM20O43506 726 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SSX4O60224 188 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 LDLRP01130 860 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 TPOP07202 933 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 UMODP07911 640 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NR2F1P10589 423 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 VPREB1P12018 145 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NNMTP40261 264 aa3.64□□□□□ -1.83
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