RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 KLRC2P26717 231 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CRYBG2Q8N1P7 616 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 NEMP2A6NFY4 417 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GPX6P59796 221 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MFSD10Q14728 455 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TFAP2BQ92481 460 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MED11Q9P086 117 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CES1P23141 567 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPN9P43378 593 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CXCR3P49682 368 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 RAPSNQ13702 412 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF404Q494X3 552 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF773Q6PK81 442 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ING5Q8WYH8 240 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 AAASQ9NRG9 546 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CCR10P46092 362 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 HUNKP57058 714 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDH1Q08174 1060 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 C2CD4BA6NLJ0 364 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SMARCB1Q12824 385 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 NAT16Q8N8M0 369 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 BSNDQ8WZ55 320 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 UFD1Q92890 307 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GJB1P08034 283 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 IQCCQ4KMZ1 466 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PRR23CQ6ZRP0 262 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 HID1Q8IV36 788 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXL20Q96IG2 436 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ITPAQ9BY32 194 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MKLN1Q9UL63 735 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SCRN3Q0VDG4 424 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF2H2Q13888 395 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 RFKQ969G6 155 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 INMTO95050 263 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DLDP09622 509 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 VBP1P61758 197 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 IKBKEQ14164 716 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 IFI44LQ53G44 452 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLITRK4Q8IW52 837 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SPAG16Q8N0X2 631 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC6A15Q9H2J7 730 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPB11Q9Y547 144 aa18.36■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CCNCP24863 283 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SGCGQ13326 291 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 STYXQ8WUJ0 223 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCB7O75027 752 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PRPS2P11908 318 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPRAP18433 802 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 MAB21L1Q13394 359 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 IDNKQ5T6J7 187 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC38A4Q969I6 547 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 AURKAO14965 403 aa18.35■□□□□ 0.53
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF432O94892 652 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms