RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 DPP9Q86TI2 863 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CTAGE6Q86UF2 777 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ERICH1Q86X53 443 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 MMGT1Q8N4V1 131 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 MUL1Q969V5 352 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 TSC22D3Q99576 134 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM50BQ9Y247 325 aa3.61□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 MYH4Q9Y623 1939 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 MROH7Q68CQ1 1323 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GUL6 1792 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ERCC6L2Q5T890 1561 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 PIK3C2BO00750 1634 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 SERPINC1P01008 464 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 GSTA2P09210 222 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 CPA3P15088 417 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 NECTIN1Q15223 517 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO43Q4G163 708 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 EMBQ6PCB8 327 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 CENPTQ96BT3 561 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 OPTNQ96CV9 577 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM81BQ96LP2 452 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 SYT15Q9BQS2 421 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 RTKNQ9BST9 563 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-202ENST00000367364 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-202ENST00000367364 ERVK-10P10266 1014 aa3.59□□□□□ -1.83
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