RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR135Q8IZ08 494 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF347Q96SE7 839 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POLE3Q9NRF9 147 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARVCFO00192 962 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SNPHO15079 494 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AP1S2P56377 157 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERVK-21P61565 698 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBE2QL1A1L167 161 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNFRSF11BO00300 401 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SERPINA1P01009 418 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FOXM1Q08050 763 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NDUFA5Q16718 116 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC157Q569K6 752 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OAFQ86UD1 273 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR10G6Q8NH81 332 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC38A4Q969I6 547 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA2Q9UM82 520 aa16.06■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC182A6NF36 153 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA31D3P0C874 917 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GALNT2Q10471 571 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LPCAT4Q643R3 524 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CAPN8A6NHC0 703 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 QPRTQ15274 297 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OVCA2Q8WZ82 227 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PIK3CBP42338 1070 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAB25P57735 213 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RALGDSQ12967 914 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNF44Q7L0R7 432 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CIB1Q99828 191 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PIGVQ9NUD9 493 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SP2Q02086 613 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRKCZQ05513 592 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KLHL12Q53G59 568 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LIX1Q8N485 282 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CMTM6Q9NX76 183 aa16.05■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLDN4O14493 209 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NRP1O14786 923 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAPK10P53779 464 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RFC2P35250 354 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BNC1Q01954 994 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC18A2Q05940 514 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HLA-DQB2P05538 268 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms