RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 HPCAL1P37235 193 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RHDQ02161 417 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 KAT5Q92993 513 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 OSMRQ99650 979 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.21□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 AZIN1O14977 448 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MICAL2O94851 1124 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CSH1P0DML2 217 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CSH2P0DML3 217 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 FMO3P31513 532 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ACSL1P33121 698 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 GPC1P35052 558 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SLC13A2Q13183 592 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB6Q15916 424 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 BSNDQ8WZ55 320 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CMAHPQ9Y471 501 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 OR5F1O95221 314 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MLYCDO95822 493 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CDKN2CP42773 168 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CEBPGP53567 150 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM199Q8N511 208 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RNF6Q9Y252 685 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 DISP2A7MBM2 1401 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SUV39H1O43463 412 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MT-ND1P03886 318 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 DNASE1P24855 282 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 EVI2BP34910 448 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM15Q13444 863 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 HYIQ5T013 277 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SSX9Q7RTT3 188 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 E9PAM4 449 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 KLF11O14901 512 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 FAM189A1O60320 539 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 FAM131BQ86XD5 332 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 METTL4Q8N3J2 472 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 USP29Q9HBJ7 922 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CPB2Q96IY4 423 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 EBF4Q9BQW3 602 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 XPNPEP2O43895 674 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CSF2P04141 144 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 LGALS2P05162 132 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 C7P10643 843 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 PCSK2P16519 638 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 MIB1Q86YT6 1006 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CPQQ9Y646 472 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 OR56A5P0C7T3 313 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TFEBP19484 476 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 RAB10P61026 200 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SLC3A1Q07837 685 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 TEAD4Q15561 434 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 PNCKQ6P2M8 343 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ILDR2Q71H61 639 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CUZD1Q86UP6 607 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 SLC9A6Q92581 669 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms