RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GGA3-208	ENST00000579743	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	MAP3K7	O43318	606 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NDUFA10	O95299	355 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	STAT5A	P42229	794 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CHRNA4	P43681	627 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CDC20	Q12834	499 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GSE1	Q14687	1217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	STARD8	Q92502	1023 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CD180	Q99467	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GBA3	Q9H227	469 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NKX2-8	O15522	239 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A9	O60656	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TJP3	O95049	919 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	LCA5L	O95447	670 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DLGAP3	O95886	979 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	BRAF	P15056	766 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A6	P19224	532 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A1	P22309	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A4	P22310	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FECH	P22830	423 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DLST	P36957	453 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HADHA	P40939	763 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ACY1	Q03154	408 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RPE65	Q16518	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ULK4	Q96C45	1275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26

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