RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 AIF1P55008 147 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 NKG7Q16617 165 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZNF773Q6PK81 442 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PGBD5Q8N414 524 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 STON2Q8WXE9 905 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SLC35B4Q969S0 331 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RNF112Q9ULX5 631 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 AP3B1O00203 1094 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 GPR39O43194 453 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 GPIP06744 558 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SLC2A3P11169 496 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PIK3CGP48736 1102 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OXCT1P55809 520 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RBBP7Q16576 425 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ARTNQ5T4W7 220 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.05□□□□□ -0.169e-8■□□□□ 10.7
PRAME-214ENST00000543184 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SPARTQ8N0X7 666 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FRS2Q8WU20 508 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 VPS51Q9UID3 782 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CLPXO76031 633 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OR4F21O95013 312 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZNF12P17014 697 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 MTHFRP42898 656 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 POLD2P49005 469 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 IL1RL1Q01638 556 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZFP90Q8TF47 636 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CD320Q9NPF0 282 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 OSER1Q9NX31 292 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 GPR182O15218 404 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 IRAK2O43187 625 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 LDB2O43679 373 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 KATNA1O75449 491 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ECI2O75521 394 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SLC22A3O75751 556 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TBX18O95935 607 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PEX11BO96011 259 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 HTR6P50406 440 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ATP4BP51164 291 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SFRP1Q8N474 314 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CALML6Q8TD86 181 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CCDC138Q96M89 665 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PSME2Q9UL46 239 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SEC14L2O76054 403 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CRHBPP24387 322 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 DNAJB1P25685 340 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 BROXQ5VW32 411 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PDPRQ8NCN5 879 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 HPS1Q92902 700 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TRMOQ9BU70 441 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 FBXO10Q9UK96 956 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TBX21Q9UL17 535 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 MUSKO15146 869 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 RHOBTB1O94844 696 aa14.03□□□□□ -0.16
PRAME-214ENST00000543184 CPNE6O95741 557 aa14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms