RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SAR1BQ9Y6B6 198 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZNF185O15231 689 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UGT1A9O60656 530 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CDK14O94921 469 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UGT1A6P19224 532 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 UGT1A4P22310 534 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 CDKN2BP42772 138 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PPP1CAP62136 330 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TLE1Q04724 770 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 DEFB109BQ30KR1 87 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 AADACL2Q6P093 401 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 C16orf46Q6P387 395 aa12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TTC30BQ8N4P2 665 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A41Q8N5S1 370 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 NAT14Q8WUY8 206 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 TEKT5Q96M29 485 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TIMM29Q9BSF4 260 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ADNPQ9H2P0 1102 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UGT1A7Q9HAW7 530 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UGT1A10Q9HAW8 530 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UGT1A8Q9HAW9 530 aa12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 CES2O00748 559 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 VEGFDO43915 354 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CEP104O60308 925 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CST8O60676 142 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RASSF9O75901 435 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 URI1O94763 535 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD34CP0C6C1 535 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 STAT5AP42229 794 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CCR10P46092 362 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 WNT3AP56704 352 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ABHD18Q0P651 414 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PTPRCAPQ14761 206 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TAZQ16635 292 aa12.4□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 PDPK2PQ6A1A2 396 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 VSIG1Q86XK7 387 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RCOR2Q8IZ40 523 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 GPR150Q8NGU9 434 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 GDAP1Q8TB36 358 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 STARD8Q92502 1023 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 OR6C1Q96RD1 312 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZPBPQ9BS86 351 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ULBP3Q9BZM4 244 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 EPN3Q9H201 632 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 EPB41L1Q9H4G0 881 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 C10orf88Q9H8K7 445 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UCK1Q9HA47 277 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SLC40A1Q9NP59 571 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 IL26Q9NPH9 171 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RAD18Q9NS91 495 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CDC23Q9UJX2 597 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PSMD13Q9UNM6 376 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.4□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RELNP78509 3460 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 GPR89AB7ZAQ6 455 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0754O94854 1291 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 FURINP09958 794 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 GPR89BP0CG08 455 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 NR1D1P20393 614 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 PTPN7P35236 360 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 CTSCP53634 463 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 CHRNA6Q15825 494 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 SLC14A2Q15849 920 aa12.39□□□□□ -0.43
PRAME-212ENST00000485532 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.39□□□□□ -0.43
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