RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 SEC24AO95486 1093 aa20.35■□□□□ 0.85
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NCKAP1-201ENST00000360982 EOGTQ5NDL2 527 aa20.33■□□□□ 0.85
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