RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228468.8

ASIC1-201, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ASIC1, Length 4,072 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1-201ENST00000228468 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 BCL10O95999 233 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 G6PDP11413 515 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 NUP107P57740 925 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TUBB3Q13509 450 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CST9Q5W186 159 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 FIBCD1Q8N539 461 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PANX1Q96RD7 426 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 RERGLQ9H628 205 aa15.94■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 LTBP1Q14766 1721 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 COCHO43405 550 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 NOBOXO60393 691 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C1QAP02745 245 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CYP11A1P05108 521 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 KCNC1P48547 511 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PRKCQQ04759 706 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CHSY3Q70JA7 882 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 LIX1Q8N485 282 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 LCHNA4D1U4 455 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 NEK2P51955 445 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TCEA2Q15560 299 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TGFBIQ15582 683 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ARMC3Q5W041 872 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 GPR180Q86V85 440 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 EBPLQ9BY08 206 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TREX1Q9NSU2 369 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 RFXANKO14593 260 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CYBAP13498 195 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 NOGQ13253 232 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ZBTB2Q8N680 514 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 FBXL20Q96IG2 436 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.93■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C5orf58C9J3I9 102 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MAPK1P28482 360 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 RGRP47804 291 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ERVK-8P63133 956 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 DAB2P98082 770 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 XKR6Q5GH73 641 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CYP20A1Q6UW02 462 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C2orf78A6NCI8 922 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 LDB2O43679 373 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 GALTP07902 379 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ALDH9A1P49189 494 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SYVN1Q86TM6 617 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PSKH2Q96QS6 385 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 UNCXA6NJT0 531 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 HSMCR30P0CW71 290 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CASP9P55211 416 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 LAPTM5Q13571 262 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PTGR1Q14914 329 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 CHRNA6Q15825 494 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.92■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 DOCK1Q14185 1865 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ILVBLA1L0T0 632 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 TMEM247A6NEH6 219 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MUSKO15146 869 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 OAZ2O95190 189 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 ARNTP27540 789 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 DOK6Q6PKX4 331 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 SLC29A1Q99808 456 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.91■□□□□ 0.14
ASIC1-201ENST00000228468 G3V2T6 193 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms