RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 AMZ2Q86W34 360 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NXPE2Q96DL1 559 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 RANBP9Q96S59 729 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 EPG5Q9HCE0 2579 aa18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PDZK1P1A8MUH7 402 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SGTAO43765 313 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF2O75151 1096 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 BRAFP15056 766 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 IDSP22304 550 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CD1CP29017 333 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR3P46089 330 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FASLGP48023 281 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CRADDP78560 199 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 HHEXQ03014 270 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CACNG1Q06432 222 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR33Q49SQ1 333 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 COPS8Q99627 209 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 RDH14Q9HBH5 336 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.29■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 USP24Q9UPU5 2620 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMA5O15230 3695 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A0G2JNG1 304 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 KIR2DS3K7RE56 304 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FANCGO15287 622 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC2A4P14672 509 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 VCLP18206 1134 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TPSB2P20231 275 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ACRV1P26436 265 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NFE2L1Q14494 772 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNJ11Q14654 390 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 KIR2DS5Q14953 304 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TPSAB1Q15661 275 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD22Q5VYY1 191 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF534Q76KX8 674 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC9B2Q86UD5 537 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 HDAC10Q969S8 669 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC38A3Q99624 504 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CPNE7Q9UBL6 633 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SATB2Q9UPW6 733 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5K4A6NMS3 321 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 OR52A4PA6NMU1 304 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 AGRPO00253 132 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 BRINP1O60477 761 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 INHBCP55103 352 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 GABREP78334 506 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 DMPKQ09013 629 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMB3Q13751 1172 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 CLCA4Q14CN2 919 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 DBN1Q16643 649 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP9Q49MG5 647 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL7AQ4VC05 210 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 C3orf38Q5JPI3 329 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PCID2Q5JVF3 399 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PROSER1Q86XN7 944 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 SEMA6CQ9H3T2 930 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 DKK4Q9UBT3 224 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.27■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.26■□□□□ 0.51
GCSHP2-201ENST00000560971 CTAGE9A4FU28 777 aa18.26■□□□□ 0.51
GCSHP2-201ENST00000560971 ZW10O43264 779 aa18.26■□□□□ 0.51
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNJ13O60928 360 aa18.26■□□□□ 0.51
GCSHP2-201ENST00000560971 AVILO75366 819 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms