RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553301.1

AL845552.2-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AL845552.2, Length 553 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AL845552.2-201ENST00000553301 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.59■□□□□ 0.89
AL845552.2-201ENST00000553301 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.59■□□□□ 0.89
AL845552.2-201ENST00000553301 PEX13Q92968 403 aa20.59■□□□□ 0.89
AL845552.2-201ENST00000553301 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
AL845552.2-201ENST00000553301 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
AL845552.2-201ENST00000553301 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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