RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NXPE2Q96DL1 559 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 COX14Q96I36 57 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 TEX101Q9BY14 249 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 ASB8Q9H765 288 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 GPR27Q9NS67 375 aa16.65■□□□□ 0.26
PACS1-208ENST00000529677 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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PACS1-208ENST00000529677 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 UGT1A9O60656 530 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 PRSS56P0CW18 603 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 ERVK-10P10266 1014 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 UGT1A6P19224 532 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 UGT1A1P22309 533 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 ACRV1P26436 265 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 UGT1A3P35503 534 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 UGT1A5P35504 534 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 KIAA1024LP59773 190 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 CYTH2Q99418 400 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.63■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa16.62■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 A6NNZ2 444 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 UQCRHP07919 91 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 NUDT17P0C025 328 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SLC1A2P43004 574 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 TTPAP49638 278 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 CXADRP78310 365 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 CDK3Q00526 305 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 KCNC4Q03721 635 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SLC29A2Q14542 456 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 RTP5Q14D33 572 aa16.62■□□□□ 0.25
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