RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515697.5

FAM200B-222, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 607 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-222	ENST00000515697	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	OGFR	Q9NZT2	677 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ARL5A	Q9Y689	179 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	BSN	Q9UPA5	3926 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		19.89	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TJP3	O95049	919 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CTSC	P53634	463 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DMPK	Q09013	629 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KIAA1328	Q86T90	577 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DESI2	Q9BSY9	194 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PKP3	Q9Y446	797 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SPTA1	P02549	2419 aa		19.88	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KCNN4	O15554	427 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PEX26	Q7Z412	305 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	NCSTN	Q92542	709 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ART4	Q93070	314 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SPRY4	Q9C004	299 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	AMFR	Q9UKV5	643 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	C5orf60	A6NFR6	353 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KCNJ13	O60928	360 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ITGA9	Q13797	1035 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CLCA4	Q14CN2	919 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	VASH2	Q86V25	355 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	GDAP1	Q8TB36	358 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	APOL2	Q9BQE5	337 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	POT1	Q9NUX5	634 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KCTD3	Q9Y597	815 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		19.86	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	EFCAB7	A8K855	629 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	AGAP14	A8MT82	685 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	STMND1	H3BQB6	276 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	FTCD	O95954	541 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	C9	P02748	559 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	IDS	P22304	550 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CETN2	P41208	172 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	XIAP	P98170	497 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	MC2R	Q01718	297 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	GTF2H3	Q13889	308 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KCTD11	Q693B1	232 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	XKR5	Q6UX68	686 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF398	Q8TD17	642 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	HES6	Q96HZ4	224 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697		A8MU76	341 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PRAMEF1	O95521	474 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	VIP	P01282	170 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	MAPK9	P45984	424 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	GFER	P55789	205 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	RAB15	P59190	212 aa		19.84	■□□□□ 0.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KIF5A	Q12840	1032 aa		19.84	■□□□□ 0.77

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