RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 E2F6O75461 281 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRKCGP05129 697 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUP107P57740 925 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCL2L1Q07817 233 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBB3Q13509 450 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 GALNT3Q14435 633 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 KCNJ11Q14654 390 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 IYDQ6PHW0 289 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 HPS6Q86YV9 775 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMGB4Q8WW32 186 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 A0A0U1RQS6 177 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TNFRSF10AO00220 468 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 FZD6O60353 706 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 AP2A1O95782 977 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITGAXP20702 1163 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINA4P29622 427 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADRA1AP35348 466 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DRD3P35462 400 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEMG2Q02383 582 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CST6Q15828 149 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CES4AQ5XG92 561 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC35B4Q969S0 331 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARRDC3Q96B67 414 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 FICDQ9BVA6 458 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITM2AO43736 263 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 RFPL1O75677 317 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANXA9O76027 345 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PGLSO95336 258 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAPK8P45983 427 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DGKEP52429 567 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CBLBQ13191 982 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF534Q76KX8 674 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMIEQ8NEW7 156 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 VPS45Q9NRW7 570 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATG13O75143 517 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SOCS5O75159 536 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRNPP04156 253 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF23P17027 643 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CES1P23141 567 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLCN5P51795 746 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSSK4Q6SA08 328 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 RANBP10Q6VN20 620 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 RTKNQ9BST9 563 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUF2Q9BZD4 464 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYLKQ15746 1914 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 K7ESF4 209 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPINT1O43278 529 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 AVILO75366 819 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 ALPIP09923 528 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIRTP0C851 137 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAGEA6P43360 314 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SERPINB9P50453 376 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 GEMP55040 296 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAD51Q06609 339 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 CNTN1Q12860 1018 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRPSAP1Q14558 356 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms