RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 AVL9Q8NBF6 648 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SH3KBP1Q96B97 665 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 THSD1Q9NS62 852 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PAK5Q9P286 719 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ITPR1Q14643 2758 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 NBEAQ8NFP9 2946 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 OR2AG2A6NM03 316 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 E7EVH7 732 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 H7C0S8 307 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNJ13O60928 360 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SUN1O94901 812 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 TNFSF15O95150 251 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGALP20701 1170 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 IDSP22304 550 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 MC4RP32245 332 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CSF2RBP32927 897 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 LMAN1P49257 510 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DMPKQ09013 629 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 WASH2PQ6VEQ5 465 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SNX20Q7Z614 316 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 AMZ2Q86W34 360 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 STYXQ8WUJ0 223 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ULK4Q96C45 1275 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 RRP8O43159 456 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSCAN12O43309 604 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGA2BP08514 1039 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 HGFP14210 728 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 BRAFP15056 766 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC19A1P41440 591 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 GRIA1P42261 906 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNJ1P48048 391 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 LIMK2P53671 638 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CFHR1Q03591 330 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CDH17Q12864 832 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DET1Q7L5Y6 550 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 NXPE1Q8N323 547 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 OR10G6Q8NH81 332 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SGF29Q96ES7 293 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC78A2IDD5 438 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 MROH6A6NGR9 719 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 AGRPO00253 132 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DUX1O43812 170 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 GAS8O95995 478 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 VIPP01282 170 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 APRTP07741 180 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PSMA3P25788 255 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ITPKBP27987 946 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 EPHA4P54764 986 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR33Q49SQ1 333 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 CLEC14AQ86T13 490 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM48Q8IWZ4 208 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC35F6Q8N357 371 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 PRELID2Q8N945 189 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF248Q8NDW4 579 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms