RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 OLIG2Q13516 323 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ITGA9Q13797 1035 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2H3Q13889 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRPSAP1Q14558 356 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DS5Q14953 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNA6Q15825 494 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IYDQ6PHW0 289 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AVL9Q8NBF6 648 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR10G6Q8NH81 332 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PBKQ96KB5 322 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 APOL2Q9BQE5 337 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IL26Q9NPH9 171 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KCND1Q9NSA2 647 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SLC23A2Q9UGH3 650 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ARL5AQ9Y689 179 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.55□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LILRA5A6NI73 299 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRR19A6NJB7 356 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 OR5K4A6NMS3 321 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf81A6NN90 581 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF1O95521 474 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TUBB4AP04350 444 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 THRAP10827 490 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 VCLP18206 1134 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MPSTP25325 297 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AKT1P31749 480 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ADRA1AP35348 466 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK9P45984 424 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA4P54764 986 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CFHR1Q03591 330 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CLN3Q13286 438 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SQSTM1Q13501 440 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRCAPQ14761 206 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 RANBP10Q6VN20 620 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TTC25Q96NG3 672 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SMOXQ9NWM0 555 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CTAGE9A4FU28 777 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf60A6NFR6 353 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf172C9J069 976 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 UGT1A9O60656 530 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CRTAMO95727 393 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 VIPP01282 170 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 LIPCP11150 499 aa7.53□□□□□ -1.2
SGMS1-201ENST00000361543 CCL4P13236 92 aa7.53□□□□□ -1.2
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