RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 STK32CQ86UX6 486 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 IFNL1Q8IU54 200 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ITPKCQ96DU7 683 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 L3HYPDHQ96EM0 354 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 EXOC2Q96KP1 924 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SEMA3CQ99985 751 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 CHID1Q9BWS9 393 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MGEA5O60502 916 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MTHFD2P13995 350 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RFC2P35250 354 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RENBPP51606 427 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NFATC3Q12968 1075 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BNIP2Q12982 314 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ITIH5Q86UX2 942 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 FEM1CQ96JP0 617 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MRGBPQ9NV56 204 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 EXD2Q9NVH0 621 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 WDR70Q9NW82 654 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 C1RP00736 705 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RAB15P59190 212 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 LAPTM5Q13571 262 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TRPV1Q8NER1 839 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 GIPC2Q8TF65 315 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 STON2Q8WXE9 905 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ACDQ96AP0 544 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BIRC7Q96CA5 298 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 OSER1Q9NX31 292 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.95□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ASPDHA6ND91 283 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SOBPA7XYQ1 873 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NOTOA8MTQ0 251 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BTN3A1O00481 513 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SULT1C4O75897 302 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 CYBBP04839 570 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 HSD17B1P14061 328 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MORN1Q5T089 497 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 HTRA1Q92743 480 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TANKQ92844 425 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SCN4AP35499 1836 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SLC7A4O43246 635 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 LDB2O43679 373 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NOBOXO60393 691 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SHMT2P34897 504 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 OPRL1P41146 370 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 BCL2A1Q16548 175 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SCD5Q86SK9 330 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 RAET1EQ8TD07 263 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 NANOGQ9H9S0 305 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 GALPQ9UBC7 116 aa11.94□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 MMP2P08253 660 aa11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 FKBP1BP68106 108 aa11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 SELPLGQ14242 412 aa11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 KANK2Q63ZY3 851 aa11.93□□□□□ -0.5
NLRC3-201ENST00000324659 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms