RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	AVL9	Q8NBF6	648 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	NCSTN	Q92542	709 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TAAR9	Q96RI9	348 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	GBA3	Q9H227	469 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	IL17C	Q9P0M4	197 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	AMFR	Q9UKV5	643 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf81	A6NN90	581 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MU76	341 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	C9orf172	C9J069	976 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNN4	O15554	427 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	EFS	O43281	561 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A9	O60656	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNJ13	O60928	360 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PPFIA2	O75334	1257 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	VIP	P01282	170 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	THRA	P10827	490 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	LIPC	P11150	499 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	VCL	P18206	1134 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A6	P19224	532 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	IDS	P22304	550 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A1	P22309	533 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A4	P22310	534 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CSF2RB	P32927	897 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A3	P35503	534 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK9	P45984	424 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	EPHA4	P54764	986 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNA6	Q15825	494 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	AADACL2	Q6P093	401 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	RANBP10	Q6VN20	620 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX26	Q7Z412	305 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF398	Q8TD17	642 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ALG3	Q92685	438 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	FICD	Q9BVA6	458 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PDP2	Q9P2J9	529 aa		9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	C5orf60	A6NFR6	353 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	EFCAB7	A8K855	629 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ADRA1A	P35348	466 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC19A1	P41440	591 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGA9	Q13797	1035 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	MANEA	Q5SRI9	462 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		9.25	□□□□□ -0.93
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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