RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK14	O94921	469 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FTCD	O95954	541 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB4	P28070	264 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS3	P57727	454 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CXADR	P78310	365 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	OLIG2	Q13516	323 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA6	Q15825	494 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	BROX	Q5VW32	411 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	HES6	Q96HZ4	224 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FICD	Q9BVA6	458 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR39	O43194	453 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A4	P14672	509 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	NFATC2	Q13469	925 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL5A	Q9Y689	179 aa		21.46	■■□□□ 1.03
PPP4C-205	ENST00000563200	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf172	C9J069	976 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A9	O60656	530 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF10	O60809	474 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL4	P13236	92 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A6	P19224	532 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A1	P22309	533 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A4	P22310	534 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A3	P35503	534 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRCAP	Q14761	206 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	INSC	Q1MX18	579 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	JAML	Q86YT9	394 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G6	Q8NH81	332 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	APOL2	Q9BQE5	337 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SMOX	Q9NWM0	555 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PKP3	Q9Y446	797 aa		21.45	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf60	A6NFR6	353 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DUX1	O43812	170 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MPST	P25325	297 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA4	P54764	986 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	USP7	Q93009	1102 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SDK2	Q58EX2	2172 aa		21.44	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BRAF	P15056	766 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPSAP1	Q14558	356 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	AVL9	Q8NBF6	648 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC13	Q8NBP0	860 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GDAP1	Q8TB36	358 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	UCK1	Q9HA47	277 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD3	Q9Y597	815 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	LILRA5	A6NI73	299 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PPP4C-205	ENST00000563200	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02

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