RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHC2P98077 582 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DMPKQ09013 629 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJC3Q13217 504 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITIH4Q14624 930 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCL7AQ4VC05 210 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC38Q502W7 563 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 JAMLQ86YT9 394 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SERPINB12Q96P63 405 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COPS8Q99627 209 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIFC1Q9BW19 673 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TREX1Q9NSU2 369 aa16.2■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RP1P56715 2156 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGEB16A2A368 324 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 B4DGG1 531 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 QSOX1O00391 747 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOBOXO60393 691 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSTM1P09488 218 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACP5P13686 325 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNLIPP16233 465 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXN2P32314 431 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAMEP78395 509 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSTM4Q03013 218 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TUBB2AQ13885 445 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MORF4L2Q15014 288 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INSCQ1MX18 579 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PACS1Q6VY07 963 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF547Q8IVP9 402 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MPP5Q8N3R9 675 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC1Q99614 292 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC23Q9UJX2 597 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOX13Q9UN79 622 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.19■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRR19A6NJB7 356 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR5K4A6NMS3 321 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 F8W8V4 182 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTX2O75431 263 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLB1P16278 677 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MGAT1P26572 445 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARSDP51689 593 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IFI44Q8TCB0 444 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYBUQ9NX95 663 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PADI4Q9UM07 663 aa16.18■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A0G2JNG1 304 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A6NCN8 305 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM187AA6NFU0 413 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCL22O00626 93 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTI1O43156 1089 aa16.17■□□□□ 0.18
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZW10O43264 779 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms