RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 PALM2Q8IXS6 379 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35F3Q8IY50 421 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 NAT6Q93015 286 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PWWP2AQ96N64 755 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 24.5
UBE2B-208ENST00000511807 GULP1Q9UBP9 304 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 METRNQ9UJH8 293 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PADI4Q9UM07 663 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC151A5D8V7 595 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TTC4O95801 387 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 POLBP06746 335 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 GSTA2P09210 222 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ALPIP09923 528 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PIRTP0C851 137 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CTSEP14091 401 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ELK3P41970 407 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SPIDRQ14159 915 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC14Q15048 493 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MSS51Q4VC12 460 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 DPPA4Q7L190 304 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HID1Q8IV36 788 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 STYXQ8WUJ0 223 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PEX13Q92968 403 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TTC25Q96NG3 672 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 KIFC1Q9BW19 673 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 BOCQ9BWV1 1114 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CLPBQ9H078 707 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SYBUQ9NX95 663 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SOX13Q9UN79 622 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PKP3Q9Y446 797 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF711Q9Y462 761 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.25□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PSMD11O00231 422 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TOR1BO14657 336 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SPAG6O75602 509 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TCEA3O75764 348 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PRKCGP05129 697 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 UQCRHP07919 91 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 FAM153BP0C7A2 387 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MYBL2P10244 700 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C6P13671 934 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PGAM1P18669 254 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PAMP19021 973 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HTR1BP28222 390 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HMGCLP35914 325 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HADHAP40939 763 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 BLKP51451 505 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PMS2P54278 862 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CRADDP78560 199 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CFHR1Q03591 330 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MTM1Q13496 603 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ELOCQ15369 112 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ALG11Q2TAA5 492 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 FAM153CQ494X1 144 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PCSK4Q6UW60 755 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF605Q86T29 641 aa11.24□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms