RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TMEM198Q66K66 360 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KRT80Q6KB66 452 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RGMBQ6NW40 437 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SCML4Q8N228 414 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PGBD5Q8N414 524 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 APPL2Q8NEU8 664 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 HM13Q8TCT9 377 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 VPS33AQ96AX1 596 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NFS1Q9Y697 457 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TBX10O75333 385 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 STMN1P16949 149 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MMP14P50281 582 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RAD23AP54725 363 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 UBXN1Q04323 297 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 WASHC5Q12768 1159 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TNFAIP1Q13829 316 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MYLK3Q32MK0 819 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 LCN10Q6JVE6 187 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CCDC190Q86UF4 302 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KBTBD6Q86V97 674 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NRROSQ86YC3 692 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TMED6Q8WW62 240 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DNAAF4Q8WXU2 420 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DACH2Q96NX9 599 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 FIZ1Q96SL8 496 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CSF3RQ99062 836 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 C1RLQ9NZP8 487 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PPE2 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PR64 198 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GLOD5A6NK44 160 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KCNN4O15554 427 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ADAM20O43506 726 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DDNO94850 711 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MYBL1P10243 752 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FCGR1AP12314 374 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MMP9P14780 707 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 UGT1A1P22309 533 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B4P51659 736 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 STAT2P52630 851 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MYBPHQ13203 477 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NFATC4Q14934 902 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KRT79Q5XKE5 535 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C11orf88Q6PI97 169 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PET117Q6UWS5 81 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HSCBQ8IWL3 235 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GDAP1Q8TB36 358 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RMDN1Q96DB5 314 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SCMH1Q96GD3 660 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C3orf30Q96M34 536 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GCNAQ96QF7 691 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FNBP1Q96RU3 617 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PAFAH2Q99487 392 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CMKLR1Q99788 373 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms