RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ANGPTL1O95841 491 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 C1RP00736 705 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CYP2C8P10632 490 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KCNK10P57789 538 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 C3orf18Q9UK00 162 aa21.57■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CNTNAP1P78357 1384 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC16A6O15403 523 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LCP1P13796 627 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 JUNDP17535 347 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MATKP42679 507 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZNF45Q02386 682 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 UBQLNLQ8IYU4 475 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TMEM199Q8N511 208 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ST6GAL2Q96JF0 529 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NME7Q9Y5B8 376 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CLDN24A6NM45 220 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ERCC2P18074 760 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TGFBR2P37173 567 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 OR2B6P58173 313 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TUBA1BP68363 451 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 POU6F1Q14863 301 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TUBA1AQ71U36 451 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GDF15Q99988 308 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FBXO10Q9UK96 956 aa21.56■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZW10O43264 779 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 STAG3L1P0CL83 205 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PRKACBP22694 351 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SULT1E1P49888 294 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 HERVK_113P63132 956 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TRAF3Q13114 568 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 IL18R1Q13478 541 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SVOPLQ8N434 492 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TEKT5Q96M29 485 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 AZIN1O14977 448 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC14A2Q15849 920 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NEK5Q6P3R8 708 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ELMOD2Q8IZ81 293 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM86B1Q8N7N1 296 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TRIM63Q969Q1 353 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 C12orf42Q96LP6 360 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DHRS9Q9BPW9 319 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLA2Q9H6Q3 261 aa21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 A0A087WZ62 844 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NCAM2O15394 837 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MTSS1O43312 755 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ANXA6P08133 673 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FCGRTP55899 365 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PRKCDQ05655 676 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DUSP7Q16829 419 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KANK2Q63ZY3 851 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DEFB106AQ8N104 65 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NPWQ8N729 165 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FRS2Q8WU20 508 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ALG9Q9H6U8 611 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ACOT13Q9NPJ3 140 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PLSCR3Q9NRY6 295 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SSX4O60224 188 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CD36P16671 472 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 UGT2B10P36537 528 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DDOSTP39656 456 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NFKB2Q00653 900 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 RAPSNQ13702 412 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ABI1Q8IZP0 508 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms