RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 ZWINTO95229 277 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 STC1P52823 247 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 LIN52Q52LA3 116 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PRAMEF1O95521 474 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TFF2Q03403 129 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 BNIP1Q12981 228 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 DNAJC3Q13217 504 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CHRNA6Q15825 494 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 GALNTL6Q49A17 601 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ASRGL1Q7L266 308 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SCAMP4Q969E2 229 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 MOCOSQ96EN8 888 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CCT7Q99832 543 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 BOCQ9BWV1 1114 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PRSS16Q9NQE7 514 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 GALPQ9UBC7 116 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 USP34Q70CQ2 3546 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 IQCF5A8MTL0 148 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CRHR1P34998 444 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 HADHAP40939 763 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 DLG1Q12959 904 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PLPP6Q8IY26 295 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PEX13Q92968 403 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ARRDC3Q96B67 414 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TPK1Q9H3S4 243 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ASB8Q9H765 288 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 FAM50BQ9Y247 325 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.16■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 NDUFS3O75489 264 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 C1SP09871 688 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 STMN1P16949 149 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CTHP32929 405 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 IL9RQ01113 521 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 Q6ZVL8 140 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TLK1Q9UKI8 766 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 VWA7Q9Y334 891 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 EGFP01133 1207 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CCT8P50990 548 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLC12A2P55011 1212 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 RAB10P61026 200 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 GPR150Q8NGU9 434 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 NXNL1Q96CM4 212 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.15■□□□□ 0.18
CHTF18-202ENST00000317063 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 TM9SF1O15321 606 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 TAC1P20366 129 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ETV3P41162 512 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 MAGEA12P43365 314 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 PSMD8P48556 350 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 CCR3P51677 355 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.14■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms