RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 RCN3Q96D15 328 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF670Q9BS34 389 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CNTNAP1P78357 1384 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GJD3Q8N144 294 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SFRP1Q8N474 314 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 IL12RB2Q99665 862 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GAL3ST1Q99999 423 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TCF25Q9BQ70 676 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 OR52J3Q8NH60 311 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RDH11Q8TC12 318 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TIFAQ96CG3 184 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LGMNQ99538 433 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLC30A4O14863 429 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SEPT4O43236 478 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SHMT1P34896 483 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MATKP42679 507 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HID1Q8IV36 788 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MCFD2Q8NI22 146 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PPM1MQ96MI6 270 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.32■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PPLO60437 1756 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLC31A1O15431 190 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ALOX5P09917 674 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PGAM2P15259 253 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN18Q99952 460 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CD247P20963 164 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 IGFBP5P24593 272 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 BAP1Q92560 729 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 COPS4Q9BT78 406 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DUSP16Q9BY84 665 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DMTF1Q9Y222 760 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CLDN9O95484 217 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 IL7RP16871 459 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SNX7Q9UNH6 387 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MID1O15344 667 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 NETO2Q8NC67 525 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TISP43B9A030 160 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 NFATC1O95644 943 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 UGT2B4P06133 528 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CCKBRP32239 447 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf189Q5VU69 101 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TSSK3Q96PN8 268 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MED28Q9H204 178 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 BCKDKO14874 412 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TNFSF9P41273 254 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LIPEQ05469 1076 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CHST9Q7L1S5 443 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ARCQ7LC44 396 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 IL17RBQ9NRM6 502 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.31■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 VSTM5A8MXK1 200 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GLRA2P23416 452 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HSD11B1P28845 292 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SCNN1AP37088 669 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GPR65Q8IYL9 337 aa16.3■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms