RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS12P58397 1594 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 TNRQ92752 1358 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP89Q96ST8 783 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 PIP4K2BP78356 416 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL34Q8N239 644 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 MX1P20591 662 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD1Q15327 319 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR62O43379 1518 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 STARD3NLO95772 234 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 TESK2Q96S53 571 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP160Q12769 1436 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 MBIPQ9NS73 344 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KINO60870 393 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 FLIIQ13045 1269 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 HOMER1Q86YM7 354 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 MYD88Q99836 296 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRJ-208ENST00000615445 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB11FIP3O75154 756 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 STK38Q15208 465 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IL16Q14005 1332 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRCP08575 1304 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OLFM4Q6UX06 510 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 MCM4P33991 863 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM5Q9C035 493 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT85P78386 507 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPY26PQ9H489 355 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT32Q14532 448 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 HYPKQ9NX55 129 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHDP01880 384 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL24Q5JXM2 366 aa24.58■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS2O95450 1211 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 POLKQ9UBT6 870 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A087WZG4 1122 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TDO2P48775 406 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRNA2Q15822 529 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 ME1P48163 572 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-208ENST00000615445 JMYQ8N9B5 988 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms