RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 C3P01024 1663 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CPS1P31327 1500 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 OFD1O75665 1012 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 IDI1Q13907 227 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17RAQ96F46 866 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-202ENST00000586851 AOX1Q06278 1338 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 RTL1A6NKG5 1358 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.47□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.47□□□□□ -0.89
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CAPNS1-202ENST00000586851 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 MBIPQ9NS73 344 aa9.44□□□□□ -0.9
CAPNS1-202ENST00000586851 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.43□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.43□□□□□ -0.9
CAPNS1-202ENST00000586851 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.42□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.42□□□□□ -0.9
CAPNS1-202ENST00000586851 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.42□□□□□ -0.9
CAPNS1-202ENST00000586851 CABP1Q9NZU7 370 aa9.42□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.39□□□□□ -0.91
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CAPNS1-202ENST00000586851 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 USP54Q70EL1 1684 aa9.39□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 USP31Q70CQ4 1352 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB11FIP3O75154 756 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 GNAI2P04899 355 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 OSCARQ8IYS5 282 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 STK31Q9BXU1 1019 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 STAP2Q9UGK3 403 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 MSH6P52701 1360 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 DIP2AQ14689 1571 aa9.37□□□□□ -0.91
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CAPNS1-202ENST00000586851 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 BRD1O95696 1058 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.37□□□□□ -0.91
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CAPNS1-202ENST00000586851 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 ARXQ96QS3 562 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY26PQ9H489 355 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 KDRP35968 1356 aa9.37□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE1AP54750 535 aa9.36□□□□□ -0.91
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