RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.34■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 KIF2CQ99661 725 aa22.33■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 AKAP12Q02952 1782 aa22.33■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 OFD1O75665 1012 aa22.33■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.33■■□□□ 1.17
SSR4-209ENST00000482902 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.33■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 ITSN1Q15811 1721 aa22.32■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 KRT24Q2M2I5 525 aa22.31■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 TNRQ92752 1358 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 CDC45O75419 566 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 MCM10Q7L590 875 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 DCTPP1Q9H773 170 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 ACEP12821 1306 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 CHL1O00533 1208 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 NUTM2FA1L443 756 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.28■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 TERF1P54274 439 aa22.28■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.27■■□□□ 1.16
SSR4-209ENST00000482902 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.27■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.27■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 SSFA2P28290 1259 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 RGS12O14924 1447 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.26■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 KIAA0232Q92628 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.25■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 ATP10DQ9P241 1426 aa22.24■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 SOX12O15370 315 aa22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 USP6P35125 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 TTC22Q5TAA0 569 aa22.23■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 CEP85Q6P2H3 762 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 PTPRCP08575 1304 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 MSH6P52701 1360 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.21■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 USP31Q70CQ4 1352 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 LTKP29376 864 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 RTL1A6NKG5 1358 aa22.2■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 CRB1P82279 1406 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 PEAK1Q9H792 1746 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF445P59923 1031 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 MEIS3Q99687 375 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 SLC4A2P04920 1241 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 HS1BP3Q53T59 392 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.19■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.18■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.18■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 APBB1O00213 710 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 FOXO3O43524 673 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 MAP7D2Q96T17 732 aa22.17■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 ARHGEF10O15013 1369 aa22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 AK9Q5TCS8 1911 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 RABEP1Q15276 862 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 SSH2Q76I76 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.15■■□□□ 1.14
SSR4-209ENST00000482902 SDSP20132 328 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 USP26Q9BXU7 913 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 PTPRUQ92729 1446 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.12■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.12■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 G2E3Q7L622 706 aa22.12■■□□□ 1.13
SSR4-209ENST00000482902 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.12■■□□□ 1.13
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