RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-207ENST00000439600 GNPATO15228 680 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-207ENST00000439600 FOXO3O43524 673 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-207ENST00000439600 PHF14O94880 888 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-207ENST00000439600 MAP2K5Q13163 448 aa14.79□□□□□ -0.04
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LMO3-207ENST00000439600 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-207ENST00000439600 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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LMO3-207ENST00000439600 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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LMO3-207ENST00000439600 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-207ENST00000439600 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.75□□□□□ -0.05
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LMO3-207ENST00000439600 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-207ENST00000439600 IRF6O14896 467 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-207ENST00000439600 PDE4DQ08499 809 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-207ENST00000439600 PTGDRQ13258 359 aa14.73□□□□□ -0.05
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LMO3-207ENST00000439600 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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LMO3-207ENST00000439600 ABTB2Q8N961 1025 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-207ENST00000439600 USP6P35125 1406 aa14.72□□□□□ -0.05
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LMO3-207ENST00000439600 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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LMO3-207ENST00000439600 SBNO1A3KN83 1393 aa14.71□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 NSD2O96028 1365 aa14.71□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.71□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 FYB1O15117 783 aa14.7□□□□□ -0.06
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LMO3-207ENST00000439600 SSH2Q76I76 1423 aa14.67□□□□□ -0.06
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LMO3-207ENST00000439600 ARHGEF10O15013 1369 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-207ENST00000439600 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.66□□□□□ -0.06
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LMO3-207ENST00000439600 AMHR2Q16671 573 aa14.66□□□□□ -0.06
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LMO3-207ENST00000439600 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-207ENST00000439600 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-207ENST00000439600 PXDNQ92626 1479 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-207ENST00000439600 MYOM1P52179 1685 aa14.61□□□□□ -0.07
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LMO3-207ENST00000439600 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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LMO3-207ENST00000439600 FECHP22830 423 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-207ENST00000439600 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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LMO3-207ENST00000439600 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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LMO3-207ENST00000439600 AKAP12Q02952 1782 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-207ENST00000439600 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-207ENST00000439600 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-207ENST00000439600 CFAP53Q96M91 514 aa14.56□□□□□ -0.08
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