RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 MCM10Q7L590 875 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.26■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 CHL1O00533 1208 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ACEP12821 1306 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 KRT24Q2M2I5 525 aa16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0232Q92628 1395 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 TTC22Q5TAA0 569 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 PTPRCP08575 1304 aa16.24■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 NUTM2FA1L443 756 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 PTMSP20962 102 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.23■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 MRE11P49959 708 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 CEP85Q6P2H3 762 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 RGS12O14924 1447 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 ATP10DQ9P241 1426 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 MSH6P52701 1360 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 SOX12O15370 315 aa16.22■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 CASC1Q6TDU7 716 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 USP6P35125 1406 aa16.21■□□□□ 0.19
PRAME-201ENST00000398741 RABEP1Q15276 862 aa16.21■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 EID1Q9Y6B2 187 aa16.21■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 RTL1A6NKG5 1358 aa16.2■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 APBB1O00213 710 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SLC4A2P04920 1241 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 PANK2Q9BZ23 570 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 MEIS3Q99687 375 aa16.19■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF10O15013 1369 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 USP31Q70CQ4 1352 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 HMMRO75330 724 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 CRB1P82279 1406 aa16.18■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SDSP20132 328 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.17■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 USP26Q9BXU7 913 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.16■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 PEAK1Q9H792 1746 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 SSFA2P28290 1259 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 PTPRUQ92729 1446 aa16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-201ENST00000398741 FOXO3O43524 673 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 FLT4P35916 1363 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 SBNO1A3KN83 1393 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 ST18O60284 1047 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 REC8O95072 547 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 AMPHP49418 695 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 STK31Q9BXU1 1019 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 TBX22Q9Y458 520 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 DIP2AQ14689 1571 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 SSH2Q76I76 1423 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 F6X3S4 739 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 G2E3Q7L622 706 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 NUCB2P80303 420 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 GNAI2P04899 355 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 ERC2O15083 957 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 KDRP35968 1356 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 EYA1Q99502 592 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 PDE1AP54750 535 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-201ENST00000398741 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms