RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 TNRQ92752 1358 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 ITSN1Q15811 1721 aa26.62■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP85Q6P2H3 762 aa26.62■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.61■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 RGS12O14924 1447 aa26.61■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 RABEP1Q15276 862 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP10DQ9P241 1426 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.6■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 CASC1Q6TDU7 716 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 RTL1A6NKG5 1358 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 PANK2Q9BZ23 570 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 USP6P35125 1406 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC4A2P04920 1241 aa26.56■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.56■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MSH6P52701 1360 aa26.56■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 USP31Q70CQ4 1352 aa26.56■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 USP26Q9BXU7 913 aa26.56■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 NUTM2FA1L443 756 aa26.55■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.55■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 MEIS3Q99687 375 aa26.55■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 CRB1P82279 1406 aa26.54■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.54■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 HMMRO75330 724 aa26.54■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 SDSP20132 328 aa26.53■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF10O15013 1369 aa26.52■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.52■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTDSS1-201ENST00000337004 APBB1O00213 710 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SOX12O15370 315 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SSFA2P28290 1259 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.5■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.49■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.49■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 REC8O95072 547 aa26.48■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 LTKP29376 864 aa26.47■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 NUCB2P80303 420 aa26.47■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.47■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 SSH2Q76I76 1423 aa26.47■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 FOXO3O43524 673 aa26.46■■□□□ 1.83
PTDSS1-201ENST00000337004 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 PEAK1Q9H792 1746 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 ST18O60284 1047 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 SBNO1A3KN83 1393 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 FLT4P35916 1363 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.44■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.44■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 G2E3Q7L622 706 aa26.43■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 STK31Q9BXU1 1019 aa26.43■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 F6X3S4 739 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 ERC2O15083 957 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 GNAI2P04899 355 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 AMPHP49418 695 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 KDRP35968 1356 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 EID1Q9Y6B2 187 aa26.42■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.41■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 CLCN1P35523 988 aa26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE1AP54750 535 aa26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 EYA1Q99502 592 aa26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.4■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.39■■□□□ 1.82
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPRUQ92729 1446 aa26.38■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.38■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 GNAI3P08754 354 aa26.37■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 FLIIQ13045 1269 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 MCTP1Q6DN14 999 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 TBX22Q9Y458 520 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.34■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.33■■□□□ 1.81
PTDSS1-201ENST00000337004 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP8B2P98198 1209 aa26.31■■□□□ 1.8
PTDSS1-201ENST00000337004 ESPNB1AK53 854 aa26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms