RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625444.1

PSMD5-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 5, human

TSL 5 BASIC

Gene PSMD5, Length 219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD5-208	ENST00000625444	VAT1	Q99536	393 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	C9orf172	C9J069	976 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444		K7ENP7	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A9	O60656	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	AGT	P01019	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	F3	P13726	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A6	P19224	532 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A1	P22309	533 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A4	P22310	534 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CTNNA2	P26232	953 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A3	P35503	534 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FASLG	P48023	281 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	RHD	Q02161	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	INSC	Q1MX18	579 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	LRP4	O75096	1905 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TK2	O00142	265 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	KMO	O15229	486 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	EPO	P01588	193 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	APOC2	P02655	101 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC2A4	P14672	509 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CSF2RB	P32927	897 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	HMGCL	P35914	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	RWDD2B	P57060	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	DCDC1	P59894	354 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	COPS2	P61201	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	GPLD1	P80108	840 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	MPP3	Q13368	585 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	XRCC4	Q13426	336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSMD5-208	ENST00000625444	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms