RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR7P34969 479 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CRYMQ14894 314 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM259Q4ZIN3 620 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LVRNQ6Q4G3 990 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPUQ71F23 418 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TDRPQ86YL5 185 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CXorf40AQ8TE69 158 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FAF2Q96CS3 445 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RAI2Q9Y5P3 530 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR91A4D1P6 747 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS47A8MTI9 375 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TM4SF5O14894 197 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 AREL1O15033 823 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PMPCBO75439 489 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SYPP08247 313 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SSTR1P30872 391 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RANBP1P43487 201 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP8P85298 464 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNA1BQ00975 2339 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HIF1AQ16665 826 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TFDP3Q5H9I0 405 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SHOC2Q9UQ13 582 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 UPK3BL1B0FP48 263 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 UPK3BL2E5RIL1 263 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TYROBPO43914 113 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNK5O95279 499 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LHCGRP22888 699 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ETV3P41162 512 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GDF10P55107 478 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GPX6P59796 221 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS21P63220 83 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD22Q5VYY1 191 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC9A4Q6AI14 798 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NAT14Q8WUY8 206 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf82Q8WW14 230 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHDC7BQ96G42 594 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SENP1Q9P0U3 644 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 USP24Q9UPU5 2620 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8RI6L899 631 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MATN3O15232 486 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CR2P20023 1033 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ADRA1DP25100 572 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDH3A1P30838 453 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSKP43235 329 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIA4P48058 902 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXC1Q12948 553 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 INPP5AQ14642 412 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOX1Q15067 660 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SHBQ15464 509 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TEAD4Q15561 434 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SFTPA2Q8IWL1 248 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 EID2Q8N6I1 236 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 APOL2Q9BQE5 337 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH9Q9HC56 1237 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PREBQ9HCU5 417 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NPHS2Q9NP85 383 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 H7C0C1 242 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DCTN3O75935 186 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 IGFALSP35858 605 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5OP48047 213 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CCR5P51681 352 aa12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms