RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550167.5

NTM-222, Transcript of neurotrimin, human

TSL 5

Gene NTM, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NTM-222	ENST00000550167	ABCG1	P45844	678 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	CRADD	P78560	199 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	IL9R	Q01113	521 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	OVGP1	Q12889	678 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	PEX6	Q13608	980 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	CRYM	Q14894	314 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	SLMAP	Q14BN4	828 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	LRRC14	Q15048	493 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	TEAD4	Q15561	434 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	BBS9	Q3SYG4	887 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	GPR33	Q49SQ1	333 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	AP2M1	Q96CW1	435 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	PWWP2A	Q96N64	755 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	FUT8	Q9BYC5	575 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	KCTD3	Q9Y597	815 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.34	□□□□□ -0.43
NTM-222	ENST00000550167	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SPAG6	O75602	509 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	MYBL2	P10244	700 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PAM	P19021	973 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	ITPKB	P27987	946 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	NMBR	P28336	390 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	AKT2	P31751	481 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	IGFALS	P35858	605 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	MAGEA4	P43358	317 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	ARSD	P51689	593 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	CLDN6	P56747	220 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	YPEL5	P62699	121 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	VSNL1	P62760	191 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	ITGA9	Q13797	1035 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SEPT6	Q14141	434 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	IRF4	Q15306	451 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	CCDC157	Q569K6	752 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PNCK	Q6P2M8	343 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	GPR150	Q8NGU9	434 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	COX14	Q96I36	57 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	TBATA	Q96M53	351 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	TEX101	Q9BY14	249 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.33	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167		A0A1W2PR77	199 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	RAD51B	O15315	384 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	BANF1	O75531	89 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FSBP	O95073	299 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	FOXN2	P32314	431 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PFN3	P60673	137 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	NFATC2	Q13469	925 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PTPRCAP	Q14761	206 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	EMB	Q6PCB8	327 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SNX20	Q7Z614	316 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	GALNT7	Q86SF2	657 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		12.32	□□□□□ -0.44
NTM-222	ENST00000550167	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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