RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ELP6Q0PNE2 266 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 OLIG2Q13516 323 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PTK2BQ14289 1009 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SLMAPQ14BN4 828 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NR0B2Q15466 257 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ISXQ2M1V0 245 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BBS9Q3SYG4 887 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PCID2Q5JVF3 399 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BROXQ5VW32 411 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF534Q76KX8 674 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC25Q86WR0 208 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 VOPP1Q96AW1 172 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CENPTQ96BT3 561 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 HIC2Q96JB3 615 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NAT9Q9BTE0 207 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 THSD1Q9NS62 852 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SATB2Q9UPW6 733 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.28□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 HEATR9A2RTY3 570 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CAPN8A6NHC0 703 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf81A6NN90 581 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 E7ESA3 106 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 KLK10O43240 276 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 AVILO75366 819 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C1QL1O75973 258 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA6P08133 673 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CTPS1P17812 591 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MGAT1P26572 445 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA3P43357 314 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RPIAP49247 311 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF7Q14155 803 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 BRD3Q15059 726 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TCEA2Q15560 299 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PERM1Q5SV97 790 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CASC4Q6P4E1 433 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 GLMNQ92990 594 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RANBP9Q96S59 729 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LYSMD1Q96S90 227 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC61Q9BV99 259 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.27□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 LMO7DNF2Z398 122 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 YY2O15391 372 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TSHRP16473 764 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF30P17039 623 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ECHS1P30084 290 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 VIPR1P32241 457 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA4P43358 317 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 UCNP55089 124 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS3P57727 454 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 YPEL5P62699 121 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 PPARDQ03181 441 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SEPT6Q14141 434 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 POU6F1Q14863 301 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 IRF4Q15306 451 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC38Q502W7 563 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 DENND2CQ68D51 928 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 EMBQ6PCB8 327 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 MACC1Q6ZN28 852 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.26□□□□□ -0.61
UBE2B-208ENST00000511807 RELL1Q8IUW5 271 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms