RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX20Q7Z614 316 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP70Q8NHQ1 597 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SCRN2Q96FV2 425 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RTKNQ9BST9 563 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 APPL1Q9UKG1 709 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TMCO1Q9UM00 188 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 L3MBTL1Q9Y468 752 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PQ67 120 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 NEMP1O14524 444 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF197O14709 1029 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ENTPD5O75356 428 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CISD3P0C7P0 127 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TYRP14679 529 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CEBPBP17676 345 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGAXP20702 1163 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GCKP35557 465 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 HK3P52790 923 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 IL2P60568 153 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3BP2P78314 561 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A3Q00325 362 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ECT2LQ008S8 904 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNA6Q15825 494 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LEXMQ3ZCV2 418 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR33Q49SQ1 333 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM198Q66K66 360 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM215Q68D42 235 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GRAMD4Q6IC98 578 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TPRG1Q6ZUI0 275 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM136AQ96C01 138 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC3BQ96PB8 259 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 THTPAQ9BU02 230 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 BBS2Q9BXC9 721 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 EBF2Q9HAK2 575 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CLDND1Q9NY35 253 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SYCE1LA8MT33 242 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 MEI4A8MW99 385 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP6CO00743 305 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR39O43194 453 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR37L1O60883 481 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT34O76011 436 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF1O95521 474 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms