RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 SNX20Q7Z614 316 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CREG2Q8IUH2 290 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 WDR48Q8TAF3 677 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SLCO2A1Q92959 643 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SGSM3Q96HU1 749 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 OR2AG1Q9H205 316 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ASB8Q9H765 288 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GULP1Q9UBP9 304 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 HEATR9A2RTY3 570 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CPED1A4D0V7 1026 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CTAGE9A4FU28 777 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KLHL33A6NCF5 533 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 OR5K4A6NMS3 321 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KMOO15229 486 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GAS8O95995 478 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KRT14P02533 472 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 MYF5P13349 255 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GLB1P16278 677 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GRIA1P42261 906 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 LMAN1P49257 510 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ACVR1Q04771 509 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NFATC2Q13469 925 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NR1D2Q14995 579 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GUSBP11Q6P575 273 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 WASH2PQ6VEQ5 465 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NAGSQ8N159 534 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 IFI44Q8TCB0 444 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ULK4Q96C45 1275 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 GRAMD1AQ96CP6 724 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 A6NCN8 305 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 FANCGO15287 622 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PRAMEF1O95521 474 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 MT-CO3P00414 261 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 JUPP14923 745 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ITGALP20701 1170 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ACTR1BP42025 376 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 FASLGP48023 281 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ACTR1AP61163 376 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SQSTM1Q13501 440 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CAMK2BQ13554 666 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KCNJ11Q14654 390 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 POU6F1Q14863 301 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PCID2Q5JVF3 399 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 PERM1Q5SV97 790 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 IYDQ6PHW0 289 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 NXPE1Q8N323 547 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ARL14Q8N4G2 192 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KYQ8NBH2 561 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 MCUQ8NE86 351 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 TTC25Q96NG3 672 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 KLK13Q9UKR3 277 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 APC2O95996 2303 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-206ENST00000462743 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms