RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, human

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIOBP-209	ENST00000428075	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	RAD18	Q9NS91	495 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	WDR70	Q9NW82	654 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		27.57	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075		F5H423	210 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	MTX2	O75431	263 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CHRNA4	P43681	627 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	P3H4	Q92791	437 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	TAAR9	Q96RI9	348 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	KLC4	Q9NSK0	619 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		27.56	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	BMPER	Q8N8U9	685 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	OR10G6	Q8NH81	332 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	FCRL5	Q96RD9	977 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		27.55	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075		A0A0G2JNG1	304 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	GPR89B	P0CG08	455 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CD82	P27701	267 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CA5A	P35218	305 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	HMGCL	P35914	325 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	KIR2DS5	Q14953	304 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ART4	Q93070	314 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		27.54	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	DUX1	O43812	170 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	EPO	P01588	193 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	FECH	P22830	423 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	BBS12	Q6ZW61	710 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	IL26	Q9NPH9	171 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		27.53	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	MTSS1	O43312	755 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PPP2R5E	Q16537	467 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	LINC00303	Q3SY05	128 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	MANEA	Q5SRI9	462 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PID1	Q7Z2X4	250 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	SGF29	Q96ES7	293 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	VPS35	Q96QK1	796 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	OGFR	Q9NZT2	677 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	IL17C	Q9P0M4	197 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		27.52	■■■□□ 2
TRIOBP-209	ENST00000428075	OR5K4	A6NMS3	321 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	EFCAB7	A8K855	629 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075		A8MU76	341 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075		B4E171	279 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	BRAF	P15056	766 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC19A1	P41440	591 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	TSPAN7	P41732	249 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	ZNF75D	P51815	510 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	EPHA4	P54764	986 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	SPA17	Q15506	151 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TRIOBP-209	ENST00000428075	SLC1A5	Q15758	541 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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